馬英九在昨天（5月21日）上午宣誓就職，成為中華民國第12任總統。在就職演說當中，馬英九強調兩岸人民同屬中華民族，希望在「九二共識」基礎上盡早恢復商談，並呼喻：兩岸「不論在台灣海峽或國際社會，都應該和解休兵」。社科院有學者認為馬的演說充滿善意，給人很好印象。而台灣前總統陳水扁，則隨著馬英九的「上馬」，「馬上」被列為貪瀆被告偵辦。

結束陳水扁八年執政
宣誓就職典禮在上午9點於總統府進行，馬英九向國父孫中山遺像宣誓：「余必遵守憲法盡忠職務，增進人民福利，保衛國家，無負國民付託，如違誓言，願受國家嚴厲之制裁」。

從立法院長王金平手上接過「中華民國之璽」和「總統之印」後，民進黨的8年執政宣告結束，台灣第二次政黨輪替也宣告完成。在送離前總統陳水扁和前副總統呂秀蓮後，馬英九任命了劉兆玄為行政院長，並主持內閣成員的宣誓就職。

兩岸政策：不統不獨
在上午11點，馬英九和蕭萬長刻意求變，沒有在總統府發表就職演說，而轉到台北的「小巨蛋」體育館。現場有過萬觀禮嘉賓，氣氛熱鬧，不時有民眾呼喊「總統好！」等口號，除了泛藍政要外，前總統李登輝也有出席，但泛綠陣營的重量級人物如謝長廷、蘇貞昌等均拒絕出席。

在名為《人民奮起、台灣新生》（馬英九演說全文）的就職演說當中，論述最多的部分是兩岸關系，馬英九認為目前最符合主流民意的的概念則是「不統、不獨、不武」。並高調重提被民進黨否認的「九二共識」，打算在「九二共識」的基礎上，盡快恢復兩岸協商。

馬英九表示，引述國家主席胡錦濤在最近三次有關兩岸的談話，指胡錦濤「建立互信、擱置爭議、求同存異、共創雙贏」等觀點，和他的觀點相當一致。

同時，他又誠懇的呼籲：「兩岸不論在海峽或國際社會都和解休兵，並在國際組織及活動中相互協助、彼此尊重」。馬英九稱兩岸人民同屬中華民族「以世界之大、中華民族智慧之高，台灣與大陸一定可以找到和平共榮之道」。

中國社會科學院台灣研究所資深研究員李家泉表示，馬英九的演說充滿善意與和解，大陸方面評價正面。儘管在意識形態上面有分歧，但是大陸應該有包容心。

陳水扁失豁免權 頓成被告
隨著陳水扁交出政權，憲法賦予的刑事豁免權也立即消失。在陳水扁卸任後不到半小時，最高檢察署特偵組就將陳水扁列為國務機要費的貪瀆被告。

檢察署派出了8位檢察官調查此案。陳水扁被視為前第一夫人吳淑珍的貪瀆共犯，涉嫌利用職務騙取財物和偽造文書等罪名。檢察官朱朝亮表示，這次偵辦「絕對不會放水」。

據悉，陳水扁曾經使用特權，將涉案的筆錄、發票等列為國家機密，因此令審訊無法繼續。而吳淑珍則以生病為理由，只出過一次庭。檢察署昨天（21日）致函新總統馬英九，要求解密相關文件，之後才能進行偵辦。

而陳水扁在交棒後，前往一個慈善機構做環保義工，並表示他的心情非常平靜。